MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	CG	3	6	735	740	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
2	NC_007958	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
3	NC_007958	ACT	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974483
4	NC_007958	CTG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
5	NC_007958	GC	3	6	903	908	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
6	NC_007958	GAAG	2	8	918	925	50 %	0 %	50 %	0 %	91974483
7	NC_007958	GCCG	2	8	933	940	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
8	NC_007958	CGC	2	6	946	951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
9	NC_007958	CGG	3	9	965	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
10	NC_007958	CG	3	6	975	980	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
11	NC_007958	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
12	NC_007958	CGG	2	6	1023	1028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
13	NC_007958	CGC	2	6	1031	1036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
14	NC_007958	TCG	3	9	1064	1072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
15	NC_007958	CGC	3	9	1095	1103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
16	NC_007958	GCC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
17	NC_007958	GCG	2	6	1127	1132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
18	NC_007958	CTG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
19	NC_007958	CCG	2	6	1253	1258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
20	NC_007958	TCG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
21	NC_007958	CTCG	2	8	1302	1309	0 %	25 %	25 %	50 %	91974483
22	NC_007958	CGA	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
23	NC_007958	ACC	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974483
24	NC_007958	GCCG	2	8	1423	1430	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
25	NC_007958	GTG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974483
26	NC_007958	CCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
27	NC_007958	CGA	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
28	NC_007958	CGG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
29	NC_007958	CG	3	6	1568	1573	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
30	NC_007958	CAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974483
31	NC_007958	GCT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
32	NC_007958	CGT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
33	NC_007958	CG	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
34	NC_007958	TGT	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974483
35	NC_007958	GACGCT	2	12	1908	1919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91974483
36	NC_007958	GCC	2	6	1940	1945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
37	NC_007958	CGG	2	6	1950	1955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
38	NC_007958	CAC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974483
39	NC_007958	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
40	NC_007958	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
41	NC_007958	CG	3	6	2347	2352	0 %	0 %	50 %	50 %	91974484
42	NC_007958	GC	3	6	2433	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	91974484
43	NC_007958	CGAC	2	8	2465	2472	25 %	0 %	25 %	50 %	91974484
44	NC_007958	ACC	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974484
45	NC_007958	CGC	2	6	2688	2693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
46	NC_007958	TCGC	2	8	2716	2723	0 %	25 %	25 %	50 %	91974484
47	NC_007958	GAG	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974484
48	NC_007958	TAT	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91974484
49	NC_007958	ATCT	2	8	2803	2810	25 %	50 %	0 %	25 %	91974484
50	NC_007958	GC	3	6	2844	2849	0 %	0 %	50 %	50 %	91974484
51	NC_007958	CGAC	2	8	2855	2862	25 %	0 %	25 %	50 %	91974484
52	NC_007958	CCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
53	NC_007958	ACG	2	6	2975	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974484
54	NC_007958	CCG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
55	NC_007958	AAC	2	6	3097	3102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974484
56	NC_007958	TGG	2	6	3113	3118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974484
57	NC_007958	AAG	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974484
58	NC_007958	CGA	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974484
59	NC_007958	TCC	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974484
60	NC_007958	CG	3	6	3181	3186	0 %	0 %	50 %	50 %	91974484
61	NC_007958	AT	3	6	3618	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	91974485
62	NC_007958	GCTGAC	2	12	3645	3656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91974485
63	NC_007958	GCG	3	9	3676	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
64	NC_007958	GTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
65	NC_007958	TGG	2	6	3713	3718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
66	NC_007958	GCGCC	2	10	3786	3795	0 %	0 %	40 %	60 %	91974485
67	NC_007958	CGA	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
68	NC_007958	GC	3	6	3860	3865	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
69	NC_007958	CG	3	6	3902	3907	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
70	NC_007958	CGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
71	NC_007958	ACG	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
72	NC_007958	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974485
73	NC_007958	GGAC	2	8	4011	4018	25 %	0 %	50 %	25 %	91974485
74	NC_007958	GCG	2	6	4030	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
75	NC_007958	CGG	3	9	4042	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
76	NC_007958	CAGC	2	8	4080	4087	25 %	0 %	25 %	50 %	91974485
77	NC_007958	GCT	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
78	NC_007958	GGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974485
79	NC_007958	CCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
80	NC_007958	GTCGCG	2	12	4207	4218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91974485
81	NC_007958	CGCGG	2	10	4236	4245	0 %	0 %	60 %	40 %	91974485
82	NC_007958	CGC	2	6	4248	4253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
83	NC_007958	CGCGG	2	10	4267	4276	0 %	0 %	60 %	40 %	91974485
84	NC_007958	TGGA	2	8	4315	4322	25 %	25 %	50 %	0 %	91974485
85	NC_007958	GC	3	6	4325	4330	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
86	NC_007958	CG	3	6	4369	4374	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
87	NC_007958	GCC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
88	NC_007958	CGC	3	9	4401	4409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
89	NC_007958	GC	3	6	4477	4482	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
90	NC_007958	GCT	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
91	NC_007958	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
92	NC_007958	TGC	3	9	4574	4582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
93	NC_007958	CGA	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
94	NC_007958	GGT	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
95	NC_007958	CGCC	2	8	4611	4618	0 %	0 %	25 %	75 %	91974485
96	NC_007958	CG	3	6	4621	4626	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
97	NC_007958	GC	3	6	4652	4657	0 %	0 %	50 %	50 %	91974485
98	NC_007958	CGG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
99	NC_007958	CGC	2	6	4745	4750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
100	NC_007958	CCCG	2	8	4994	5001	0 %	0 %	25 %	75 %	91974486
101	NC_007958	TTCCG	2	10	5026	5035	0 %	40 %	20 %	40 %	91974486
102	NC_007958	CGA	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
103	NC_007958	CAC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974486
104	NC_007958	GTC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
105	NC_007958	GGCC	2	8	5185	5192	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
106	NC_007958	GTG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
107	NC_007958	CGA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
108	NC_007958	TCA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
109	NC_007958	CGG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
110	NC_007958	CGG	2	6	5365	5370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
111	NC_007958	CGGCGT	2	12	5377	5388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91974486
112	NC_007958	GGT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
113	NC_007958	CAT	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
114	NC_007958	T	6	6	5537	5542	0 %	100 %	0 %	0 %	91974486
115	NC_007958	GAG	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974486
116	NC_007958	GCG	2	6	5694	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
117	NC_007958	CAA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974486
118	NC_007958	TGG	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
119	NC_007958	GTGCT	2	10	5831	5840	0 %	40 %	40 %	20 %	91974486
120	NC_007958	CAA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974486
121	NC_007958	CGG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
122	NC_007958	CCGCG	2	10	5890	5899	0 %	0 %	40 %	60 %	91974486
123	NC_007958	AAG	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974486
124	NC_007958	CGA	2	6	5965	5970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
125	NC_007958	TCG	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
126	NC_007958	GGT	2	6	6070	6075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
127	NC_007958	GCA	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
128	NC_007958	GAG	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974486
129	NC_007958	TCCG	2	8	6121	6128	0 %	25 %	25 %	50 %	91974486
130	NC_007958	TCG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
131	NC_007958	GCC	4	12	6161	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
132	NC_007958	CG	3	6	6181	6186	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
133	NC_007958	GC	3	6	6191	6196	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
134	NC_007958	GC	3	6	6216	6221	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
135	NC_007958	TCG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
136	NC_007958	CCG	2	6	6309	6314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
137	NC_007958	TGC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
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